研究方向

当前位置> 首页 科研合作 研究方向

基于shotgun metabarcoding技术鉴定传统中草药品五虎散

作者:匿名 来源:互联网 时间:2021-04-24

 

 

Liu J, Mu W, Shi M , et al. The Species Identification in Traditional Herbal Patent Medicine, Wuhu San, Based on Shotgun Metabarcoding[J]. Frontiers in Pharmacology, 2021, 12.

 

       混合物中生物成分的鉴定是物种鉴定技术的难点,也是市场监管的弱点,我国曾发生多起严重的混合物中含有毒生物成分的现象,如马兜铃酸肾病事件,该事件最初由9名使用中草药减肥疗法的比利时年轻女性出现进行性慢性间质纤维化和晚期肾功能衰竭。随着更多类似的患者被发现、报道,人们意识到马兜铃酸可能是致病因素。此后,大量马兜铃酸肾病患者被报道,而且绝大多数来自亚洲,这是一类由关木通及相关的药物所造成的急性或慢性肾小管间质疾病。在食品领域,有关于“蜜蜂误采有毒植物,蜂蜜成毒蜜,多人因此丧命”的报告,我国的有毒蜜源植物较多,如雷公藤,昆明山海棠,钩吻,博落回以及乌头等有毒植物,因此开展混合物中生物成分的物种鉴定具有重要意义。


       项目研究者提出了shotgun metabarcoding技术,以实现混合物中生物成分的物种精准鉴定,该技术将高通量测序技术与DNA条形码技术相结合,基本的步骤包括:提取样品DNA,构建PCR-free测序文库,进行冗余shotgun测序,通过生物信息学分析获取混合物样品中的DNA条形码序列(ITS2, psbA-trnH, rbcL, matK),通过与数据库比对即可实现对混合物中生物成分的物种鉴定。该技术已经用于中成药五虎散的物种鉴定研究,五虎散的处方成分包含有毒药用植物天南星,论文在中科院二区杂志《frontiers in pharmacology》发表,论文致谢第1标注2019YFC1604705。